［凡例］日記目録有・日記有・Webに日記公開中・Webに未公開（アップロード予定有）※日記・日記目録残存状況表を反映しています。凡例で色付けされてない期間は、日記目録が伝存していません。
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| #1 | （寺社方抜書-879） | 文化5年閏6月12日 1808 グレゴリオ暦 1808-08-03 | 山内杉山村疫病流行候付為転除吉祥坊へ御祈祷被仰付候事関連日記画像あり | ||
| #2 | （寺社方抜書-960） | 文化9年5月12日 1812 グレゴリオ暦 1812-06-20 | 永田村并弁財搦疫病流行ニ付転除之祓并御施薬被仰付候事関連日記画像あり | ||
| #3 | （寺社方抜書-1032） | 文化14年2月8日 1817 グレゴリオ暦 1817-03-25 | 疫病流行ニ付右転除祈祷行乗坊被仰付候事 画像なし 関連日記画像あり | ||
| #4 | （寺社方抜書-1373） | 天保4年2月19日 1833 グレゴリオ暦 1833-04-08 | 芦刈流行病ニ付、祇園社御幸相成候付、社人へ御施物其外被下物之事関連日記画像あり | ||
| #5 | （寺社方抜書-1409） | 天保5年7月18日 1834 グレゴリオ暦 1834-08-22 | 深川刈流行病ニ付、行乗房え祓被仰付候事関連日記画像あり | ||
| #6 | （寺社方抜書-1433） | 天保6年3月28日 1835 グレゴリオ暦 1835-04-25 | 杉山村流行病ニ付、行乗房へ祓仰付候事関連日記画像あり | ||
| #7 | （寺社方抜書-1551） | 天保9年1月14日 1838 グレゴリオ暦 1838-02-08 | 東山田村流行病ニ付、転除御祈祷之事 | ||
| #8 | （寺社方抜書-1563） | 天保9年閏４月13日 1838 グレゴリオ暦 1838-06-05 | 里四郷流行病ニ付、行乗房へ今又祈祷被仰付候事 | ||
| #9 | （寺社方抜書-1620） | 天保10年？月？日 1839 グレゴリオ暦 1839-02-14 | 普門院え流行病払被仰付候事関連日記画像あり | ||
| #10 | （寺社方抜書-1623） | 天保10年7月13日 1839 グレゴリオ暦 1839-08-21 | 岡水刈・両織島流行病ニ付、普門院え転除払被仰付候事関連日記画像あり | ||
| #11 | （寺社方抜書-1624） | 天保10年？月？日 1839 グレゴリオ暦 1839-02-14 | 流行病ニ付、福智院へ祈祷被仰付候事関連日記画像あり | ||
| #12 | （寺社方抜書-1626） | 天保10年？月？日 1839 グレゴリオ暦 1839-02-14 | 於保村流行病ニ付、祈祷之事関連日記画像あり | ||
| #13 | （寺社方抜書-1826） | 嘉永3年7月16日 1850 グレゴリオ暦 1850-08-23 | 西山田村流行病ニ付、御祈祷之事関連日記画像あり | ||
| #14 | （寺社方抜書-1859） | 嘉永4年7月19日 1851 グレゴリオ暦 1851-08-15 | 袴田刈流行病転除御祈祷之事関連日記画像あり | ||
| #15 | （寺社方抜書-1860） | 嘉永4年8月5日 1851 グレゴリオ暦 1851-08-31 | 池上村流行病ニ付、右同断関連日記画像あり | ||
| #16 | （寺社方抜書-1866） | 嘉永4年10月3日 1851 グレゴリオ暦 1851-10-27 | 岡本刈流行病転除祈祷之事関連日記画像あり | ||
| #17 | （寺社方抜書-1973） | 安政2年4月6日 1855 グレゴリオ暦 1855-05-21 | 豊前坊祠え流行病ニ付参詣人有之候付、城備坊其外致心遣候段達出之事関連日記画像あり | ||
| #18 | （寺社方抜書-2020） | 安政3年11月5日 1856 グレゴリオ暦 1856-12-02 | 今山村流行病ニ付、御祈祷之事関連日記画像あり | ||
| #19 | （寺社方抜書-2040） | 安政4年閏5月22日 1857 グレゴリオ暦 1857-07-13 | 流行病転除御祈祷之事関連日記画像あり | ||
| #20 | （寺社方抜書-2166） | 文久2年6月19日 1862 グレゴリオ暦 1862-07-15 | 麻疹流行ニ付、山伏共え御祈祷被仰付候事関連日記画像あり |